醫(yī)藥投資:齊碳科技完成新一輪4000萬(wàn)元融資,致力于納米孔基因測(cè)序技術(shù)研發(fā)

專(zhuān)注于創(chuàng)新納米孔單分子基因測(cè)序技術(shù)的齊碳科技近日宣布完成第三輪4000萬(wàn)元人民幣融資,本輪投資方為中關(guān)村協(xié)同創(chuàng)新基金、雅惠精準(zhǔn)醫(yī)療基金。據(jù)了解,本次融資將主要用于新一代納米孔基因測(cè)序儀的技術(shù)研發(fā)、設(shè)備采購(gòu)及人員招募。


齊碳科技成立于2016年9月,采用納米孔基因測(cè)序技術(shù),自主開(kāi)發(fā)快速、低成本、小型化的第四代基因測(cè)序儀和配套試劑。本輪融資完成前,齊碳科技已經(jīng)累計(jì)獲得2300萬(wàn)元融資,資方包括天使投資機(jī)構(gòu)合力投資、華控基石基金等,風(fēng)險(xiǎn)投資機(jī)構(gòu)百度風(fēng)投等。


基因測(cè)序技術(shù)的大量應(yīng)用與四次迭代


自2006年最早出現(xiàn)在科研CRO服務(wù)中始,基因測(cè)序快速大規(guī)模進(jìn)入臨床領(lǐng)域,提供豐富生物信息解讀數(shù)據(jù)的同時(shí),幫助醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)實(shí)現(xiàn)跨越式進(jìn)展。根據(jù)基因慧預(yù)測(cè),2019年基因測(cè)序行業(yè)全球市場(chǎng)規(guī)模達(dá)到145億美元,CAGR達(dá)到25%。國(guó)內(nèi)市場(chǎng)規(guī)模預(yù)計(jì)30億美元,主要影響因素為產(chǎn)品審批、定價(jià)和市場(chǎng)教育。


期間,主流基因測(cè)序技術(shù)完成了四次迭代,科研人員圍繞更高通量、更長(zhǎng)讀長(zhǎng)、更低成本的基因測(cè)序積累了大量嘗試。


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四代測(cè)序技術(shù)對(duì)比(動(dòng)脈網(wǎng)根據(jù)公開(kāi)資料整理)


其中,一代測(cè)序由于通量低、成本高,難以滿(mǎn)足現(xiàn)代生信分析模型對(duì)于數(shù)據(jù)體量的要求,逐漸淡出測(cè)序舞臺(tái),二代測(cè)序即NGS成為近十年來(lái)的主流基因測(cè)序技術(shù)。目前,二代基因測(cè)序儀市場(chǎng)基本被Illumina、Thermo Fisher等海外巨頭控制,國(guó)內(nèi)基因測(cè)序公司則多位于行業(yè)中下游,或購(gòu)買(mǎi)測(cè)序儀提供基因測(cè)序服務(wù),或?yàn)闇y(cè)序結(jié)果提供數(shù)據(jù)分析服務(wù),相對(duì)較弱的市場(chǎng)議價(jià)能力無(wú)疑制約了行業(yè)發(fā)展。


不過(guò),由于NGS讀長(zhǎng)短、操作難度大,無(wú)法覆蓋更廣泛臨床場(chǎng)景下復(fù)雜樣本的測(cè)序需求。近年來(lái),以單分子熒光測(cè)序和單分子納米孔測(cè)序?yàn)樵淼娜退拇鷾y(cè)序技術(shù)得到快速發(fā)展,其超長(zhǎng)讀長(zhǎng)、靈活便捷的特點(diǎn)點(diǎn)燃了產(chǎn)業(yè)界對(duì)基因測(cè)序應(yīng)用新的熱情。


隨著牛津納米孔科技在2012年發(fā)布首款便攜式基因測(cè)序儀MinION,越來(lái)越多的生物科技公司和大型企業(yè)布局單分子測(cè)序賽道。2015年,羅氏收購(gòu)Life Science,后者曾發(fā)布454測(cè)序平臺(tái);2016年,Illumina在Solexa發(fā)布單分子測(cè)序儀Genome Analyzer后將其收購(gòu),美國(guó)生物系統(tǒng)公司也于同年收購(gòu)擁有單分子測(cè)序儀SoLid的Agent Count。


目前,Pacific Bioscience和Oxford Nanopore是國(guó)際上主流的單分子測(cè)序儀制造商,他們分別基于單分子熒光測(cè)序技術(shù)和納米孔測(cè)序技術(shù)提供滿(mǎn)足不同功能的基因測(cè)序儀。


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主流單分子測(cè)序儀(動(dòng)脈網(wǎng)根據(jù)公開(kāi)資料整理)


其中,以納米孔測(cè)序?yàn)樵淼乃拇鷾y(cè)序技術(shù)由于減少了三代測(cè)序的復(fù)雜光學(xué)設(shè)備和移液機(jī)械結(jié)構(gòu),能夠?qū)崿F(xiàn)更經(jīng)濟(jì)便捷的測(cè)序。納米孔分析技術(shù)起源于Coulter計(jì)數(shù)器的發(fā)明以及單通道電流的記錄技術(shù),1996年,隨著利用α-溶血素對(duì)DNA測(cè)序新設(shè)想的提出,生物納米孔單分子測(cè)序進(jìn)入發(fā)展快車(chē)道。經(jīng)過(guò)二十幾年迭代,納米孔測(cè)序技術(shù)開(kāi)始趨于成熟。


納米孔測(cè)序基本工作原理是,將蛋白質(zhì)納米孔嵌入磷脂膜并置于充滿(mǎn)電解液的腔內(nèi),納米孔只允許單鏈核酸分子通過(guò)。當(dāng)電壓作用于電解液時(shí),由于四種堿基結(jié)構(gòu)(ATCG)結(jié)構(gòu)不同,通過(guò)納米孔時(shí)會(huì)產(chǎn)生差異化的電信號(hào)強(qiáng)度,造成電流跳變。這種電信號(hào)被測(cè)量并記錄后,經(jīng)數(shù)據(jù)分析可識(shí)別通過(guò)納米孔的堿基序列。


納米孔測(cè)序無(wú)需標(biāo)記、無(wú)需放大,在讀長(zhǎng)和時(shí)間上優(yōu)于傳統(tǒng)二代測(cè)序,并實(shí)現(xiàn)單分子檢測(cè)技術(shù),有望在DNA、RNA、蛋白質(zhì)等多種重大疾病生物標(biāo)志物檢測(cè)方面得到廣泛應(yīng)用。


跨學(xué)科合作團(tuán)隊(duì),讓國(guó)產(chǎn)四代基因測(cè)序儀成為可能


齊碳科技核心創(chuàng)始人白凈衛(wèi)博士第一次接觸到納米孔測(cè)序技術(shù)的時(shí)候,納米孔測(cè)序還做不到單堿基分辨,測(cè)序信號(hào)捕捉也極不穩(wěn)定,“但我個(gè)人很喜歡,并且看好這項(xiàng)技術(shù)?!?他曾在全球最早嘗試通過(guò)對(duì)含有多層金屬電極的固態(tài)納米孔施加電壓以控制核酸運(yùn)動(dòng)和檢測(cè)核酸序列,踩過(guò)很多坑。


失敗的經(jīng)歷讓白凈衛(wèi)得以看清納米孔測(cè)序技術(shù)應(yīng)有的發(fā)展路徑,他分析認(rèn)為,納米孔測(cè)序需要突破兩個(gè)關(guān)鍵點(diǎn),第一,找到合適的納米孔,以實(shí)現(xiàn)單堿基分辨;第二,采用合適手段讓DNA勻速通過(guò)納米孔。納米孔技術(shù)的后續(xù)發(fā)展,驗(yàn)證了他曾經(jīng)的判斷。


2016年中旬,白凈衛(wèi)回到國(guó)內(nèi),聯(lián)合胡賡、謝丹、陳呈堯三位博士創(chuàng)辦了齊碳科技,繞過(guò)二代基因測(cè)序紅海市場(chǎng),基于納米孔技術(shù)開(kāi)發(fā)全新技術(shù)原理的基因測(cè)序設(shè)備。納米孔測(cè)序技術(shù)的學(xué)科交叉特點(diǎn)明顯,從蛋白工程、流體芯片到電信號(hào)采集處理,對(duì)研發(fā)團(tuán)隊(duì)的跨學(xué)科綜合處理能力要求極高。四人組成的創(chuàng)業(yè)團(tuán)隊(duì)正好契合了跨學(xué)科需求,也成為他們的獨(dú)特優(yōu)勢(shì)。


白凈衛(wèi)本科畢業(yè)于北京大學(xué)化學(xué)系,是加州大學(xué)洛杉磯分校材料學(xué)博士,從IBM沃森實(shí)驗(yàn)室博士后出站后,他曾在Illumina公司從事基因測(cè)序技術(shù)研發(fā),有超過(guò)10年的微納器件研發(fā)經(jīng)驗(yàn);胡庚博士畢業(yè)于清華大學(xué)自動(dòng)化系,是電子儀器專(zhuān)家,曾領(lǐng)導(dǎo)了西門(mén)子中國(guó)的首個(gè)達(dá)到SIL-3級(jí)功能安全標(biāo)準(zhǔn)的過(guò)程儀表產(chǎn)品線研發(fā)項(xiàng)目,并入選2015年西門(mén)子中國(guó)Young Talent;謝丹博士是生物信息學(xué)專(zhuān)家,伊利諾伊大學(xué)香檳分校生物醫(yī)學(xué)工程博士,斯坦福大學(xué)醫(yī)學(xué)院博士后,他在測(cè)序技術(shù)和生物信息學(xué)領(lǐng)域積累豐富,主要負(fù)責(zé)測(cè)序儀后端信號(hào)分析;陳呈堯博士是蛋白工程專(zhuān)家,曾在Life Technology和Illumina擔(dān)任資深研究員,并由于為Illumina測(cè)序試劑性能提高所做出的突出貢獻(xiàn)獲得2013年Illumina Innovation Award獎(jiǎng)勵(lì),在齊碳科技負(fù)責(zé)蛋白生化的技術(shù)研發(fā)。


2017年2月,齊碳科技獲得合力投資等機(jī)構(gòu)的天使輪投資,隨后完成原理樣機(jī)設(shè)計(jì)。驗(yàn)證技術(shù)可行性的同時(shí),齊碳科技開(kāi)始受到資本市場(chǎng)關(guān)注。次年2月,齊碳科技完成由華控基石基金和百度風(fēng)投領(lǐng)投的第二輪2000萬(wàn)元融資,團(tuán)隊(duì)成員快速擴(kuò)張到20余人。


2018年,齊碳科技一方面為具有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的控速蛋白申請(qǐng)國(guó)內(nèi)專(zhuān)利,構(gòu)建技術(shù)壁壘,另一方面對(duì)原理樣機(jī)進(jìn)行迭代,將原本16通道拓展到64個(gè)通道,測(cè)序數(shù)據(jù)分析算法準(zhǔn)確率從80%提高到90%。據(jù)胡庚介紹,齊碳科技擁有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的首款納米孔測(cè)序儀QNOME-6410已經(jīng)完成工程樣機(jī)的研發(fā),將于2020年初推出最小可行化產(chǎn)品。


QNOME-6410輕巧便捷,一鍵完成操作,達(dá)到10kbp以上超長(zhǎng)讀長(zhǎng),支持即時(shí)診斷,并且單次運(yùn)行成本低,以中高通量完成準(zhǔn)確率超過(guò)90%的基因測(cè)序,可以為從事病原體研究的科研機(jī)構(gòu)提供數(shù)據(jù)服務(wù)。


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QNOME-6410概念圖(受訪者供圖)


目前技術(shù)條件下,納米孔高通量測(cè)序的成本很高。齊碳科技的解決方案能夠?qū)崿F(xiàn)穩(wěn)定的雙層膜流體芯片構(gòu)造、穩(wěn)定的控速蛋白、精度可調(diào)的納米孔蛋白,將流體芯片與后端復(fù)雜、昂貴的檢測(cè)電路分離,并且具有穩(wěn)定的測(cè)序表現(xiàn),這將極大減少耗材成本。此外,齊碳科技自主設(shè)計(jì)的電化學(xué)傳感裝置ASIC芯片,能夠精準(zhǔn)檢測(cè)pA級(jí)別的微弱電流,結(jié)合自主研發(fā)的多重深度學(xué)習(xí)算法能夠提供更多分子層面信息。


探索基因檢測(cè)新場(chǎng)景


白凈衛(wèi)指出,由于更靈活、易攜帶、成本低、耗時(shí)短,納米孔測(cè)序技術(shù)可以讓基因測(cè)序應(yīng)用到更多新的場(chǎng)景。


一方面,納米孔測(cè)序儀有望把科研工作從實(shí)驗(yàn)室里解放出來(lái),不再局限于把樣本帶回實(shí)驗(yàn)室分析的傳統(tǒng)固有模式,而是把測(cè)序儀帶到一線研究現(xiàn)場(chǎng),快速方便地測(cè)序;另一方面,這一技術(shù)也讓家用測(cè)序儀成為可能,在更多存在可視化和快速需求的場(chǎng)景下得到應(yīng)用。


更重要的是,納米孔測(cè)序技術(shù)能夠彌補(bǔ)NGS技術(shù)的不足。例如,利用超長(zhǎng)讀長(zhǎng),可以對(duì)病原體等生物進(jìn)行準(zhǔn)確測(cè)序,避免片段拼接引入的錯(cuò)誤。在病原微生物測(cè)序中,由于病毒和細(xì)菌形成混合物,堿基片段非常相似,NGS技術(shù)往往只能檢測(cè)出多種細(xì)菌的共性片段,從而很難準(zhǔn)確判定細(xì)菌類(lèi)型,但長(zhǎng)片段的納米孔測(cè)序則能夠更精確地對(duì)病原體分類(lèi)進(jìn)行定位。


不過(guò),白凈衛(wèi)強(qiáng)調(diào),納米孔測(cè)序在準(zhǔn)確率、穩(wěn)定性、樣本類(lèi)型等方面還存在全鏈條提升的空間,測(cè)序平臺(tái)構(gòu)建和市場(chǎng)培訓(xùn)是齊碳科技當(dāng)前很重要的任務(wù)。胡庚告訴動(dòng)脈網(wǎng),齊碳科技接觸了國(guó)內(nèi)多家知名醫(yī)院,后者對(duì)納米孔測(cè)序技術(shù)十分期待,“公司會(huì)在臨床驗(yàn)證技術(shù)成果的同時(shí),基于自身對(duì)納米孔測(cè)序的理解和研發(fā)經(jīng)驗(yàn)進(jìn)行前期布局,嘗試解決臨床問(wèn)題?!?/p>


正如白凈衛(wèi)所言,納米孔測(cè)序的底層技術(shù)開(kāi)始趨于成熟,而臨床應(yīng)用尚未完全成型,此時(shí)入局正當(dāng)時(shí)。